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上海交通大学研究生院于1996年2月首批被批准正式成立。目前，已建立了哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、军事学、管理学等全部12个学位门类的研究生培养体系。上海交通大学研究生院现有一级学科博士点22个，二级学科博士点147个（其中26个为自设博士点），共涉及63个一级学科；一级学科硕士点18个，二级学科硕士点267个，硕士专业学位授权点共11个（工商管理硕士（MBA、EMBA）、会计硕士（MPAcc）、公共管理硕士（MPA）、法律硕士（J. M）、兽医硕士、风景园林硕士、农业推广硕士（种植、农村与区域发展）、临床医学硕士（M.M）、口腔医学硕士（S.M.M）、翻译硕士（M.T.I）、工程硕士），博士专业学位授权点2个（临床医学博士（M.D）口腔医学博士（S.M.D））。
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