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地球化学研究所的主体由中国科学院地质研究所从北京搬迁而来，在国内率先建立了矿床地球化学、环境地球化学、天体化学、高温高压实验地球化学、同位素地球化学、流体包裹体地球化学等地球化学学科体系；是我国首批具有博士、硕士学位授权单位、首批博士后流动站建站单位和全国一级学会—中国矿物岩石地球化学学会挂靠单位；作为主持单位取得了包括获国家自然科学一等奖在内的一系列重要学术成果；在研究所工作的11位科学家先后入选中国科学院院士。
地球化学研究所的战略定位是围绕国家战略需求和国际地球科学前沿，以地球和行星演化、地球各圈层物质循环的地球化学过程及其资源环境效应为主线，开展基础性、战略性和前瞻性研究，完善和创新地球化学理论和应用体系，提升解决我国固体矿产资源开发与生态环境治理等问题的科技支撑能力，为地球化学学科发展和国民经济建设作出重要贡献，成为我国地球和行星演化、固体矿产资源与喀斯特生态环境研究的重要基地及地球化学优秀人才的培养摇篮。
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