北京公共卫生信息中心位于北京市宣武区北纬路59号，是北京市卫生局所属全额拨款事业单位，主要组织开展北京市卫生局综合指挥调度信息平台、北京市妇幼保健网络信息系统、北京市卫生监督执法综合信息管理系统、北京市疾病监测预警、卫生信息综合采集平台、北京市卫生电子政务平台、社区卫生综合管理信息系统、新型农村合作医疗管理信息系统、血液管理信息系统、安全防护信息系统等项目的规划、建设和实施。
北京公共卫生信息中心负责北京市公共卫生信息系统建设规划的组织实施，落实北京地区卫生信息资源整合的具体工作，以及有关公共卫生信息数据统计及分析，形成了“北京市公共卫生地理信息系统”、“公共卫生GIS图层分类标准”和“北京市公共卫生信息系统指标代码体系与数据结构”等工作成果。
北京公共卫生信息中心负责北京市公共卫生信息系统建设规划的组织实施，落实北京地区卫生信息资源整合的具体工作，以及有关公共卫生信息数据统计及分析，形成了“北京市公共卫生地理信息系统”、“公共卫生GIS图层分类标准”和“北京市公共卫生信息系统指标代码体系与数据结构”等工作成果。
